המרכז הישראלי למוגנות מבצע אבחון והערכת מסוכנות קהילתית של עברייני מין קטינים ובגירים באמצעות אנשי מקצוע המומחים בכך כגון: פסיכיאטרים, פסיכולוגים ועובדים סוציאליים. התהליך מתבצע לבקשת הקהילה בה התקיימו הפגיעות ודומה במהותו להערכת מסוכנות של עברייני מין לקראת מתן גזר דין או חופשה ממאסר.

הערכה זו קובעת עד כמה העבריין יהווה סיכון לאנשים אחרים. מסקנות האבחון ישמשו את רשויות אכיפת החוק והקהילה עצמה ויקבעו את אפשרות שילוב הפוגע בקהילה ואת התכנית הטיפולית.

המרכז מציע סדנאות מוגנות ומיזמים חינוכיים בנושא ניצול ופגיעה בקרב מינית המותאמים לילדי הגנים, תלמידי בתי הספר, הורים וסגלי

קידום הוראה ליצירת שינוי תודעתי. כארגון ארצי הזוכה לאמון וגישה פעולה קהילות רבות, המרכז מעודד את דרכי המניעה השונות כגון:

חקיקה. המחקר האקדמי בתחום, מיסוד תכניות חוסן לאומיות, שיתופי עם הרשויות השונות להכשרת הצוות וקידום.